Hajdina è menzionata per la prima volta nei documenti medievali nell'anno 1164. Nell'anno 1202 è già divisa in quella Di sotto - Spodnja (proprietà di Salisburgo) e quella Di sopra – Zgornja (proprietà del principato provinciale) con la corte e la chiesa. L'ufficio dei signori con la corte è menzionato anche nel XVI e XVII secolo ma oggi non c'è ne più nessuna traccia. All'inizio del XIX secolo il borgo di Hajdina consisteva di 86 case con 399 abitanti, ma alla fine del XIX secolo aveva già 123 case con 635 abitanti e due mercati del bestiame che si svolgevano il 1° maggio e il 30 agosto. Gliabitanti erano agricoltori, allevatori del bestiame e apicoltori.
Dopo l'anno 1850,quando sono stati fondati i comuni, il comune di Hajdina aveva la sede a Zgornja Hajdina. Fino all'anno 1952 era un comune autonomo, da allora fino all'anno 1999 faceva parte del comune di Ptuj per diventare di nuovo un comune autonomo nel 1999. Il comune è composto da sette abitati tutti ruralmente urbanizzati. Prevalgono i nuclei familiari non contadini e misti.
Economicamente rientra nei comuni mediamente sviluppati. Numerosi circoli hanno cura della vita sociale dei cittadini e nello stesso tempo mantengono e rappresentano il patrimonio naturale e culturale di quest'area.